SSR1コース
【第一部】
| オックス・ファイア | 弱点：チェインバブル | 入手：テイルバーナー |
| ウルフ・フォレスト | 弱点：テイルバーナー | 入手：タイボクザン |
| ジェミニ・スパーク | 弱点：タイボクザン | 入手：ライメイザン |
| キャンサー・バブル | 弱点：ライメイザン 弱点2：ステルスレーザー |
入手：チェインバブル |
【第二部】
| キズナス・ウィング | 弱点：ヘビードーン 弱点2：ライメイザン |
入手：タイフーンダンス |
| リブラ・バランス | 弱点：ドリルアーム 弱点2：ヘビードーン |
入手：ヘビードーン |
| オヒュカス・クイーン | 弱点：タイフーンダンス 弱点2：テイルバーナー |
入手：スネークレギオン |
| クラウン・サンダー | 弱点：スネークレギオン 弱点2：タイボクザン |
入手：ドリルアーム |
【ラスト】
| アンドロメダ | 弱点：なし | 入手：なし |
【SP】
| ライマー | 弱点：チェインバブル | 入手：なし |
※SPボスはゲーム開始からラスボス撃破までのタイムが短いと出現。
相性(弱点攻撃による攻略例)
【第一部】
オックス→ウルフ→ジェミニ→キャンサー→(オックス...)
【第二部】
クラウン→リブラ→キグナス→オヒュカス→(クラウン...)
【第一部】
オックス→ウルフ→ジェミニ→キャンサー→(オックス...)
【第二部】
クラウン→リブラ→キグナス→オヒュカス→(クラウン...)
SSR2コース
【第一部】
| ファントム・ブラック | 弱点：ヘンゲノジュツ | 入手：ロングソード |
| イエティ・ブリザード | 弱点：ロングソード | 入手：スノーボール |
| ブラキオ・ウェーブ | 弱点：ステルスレーザー | 入手：アクアウェーブ |
| ゴート・カンフー | 弱点：アクアウェーブ | 入手：ヘンゲノジュツ |
| コンドル・ジオグラフ | 弱点：スノーボール | 入手：ステルスレーザー |
【第二部】
| オリガ・ジェネラル | 弱点：なし | 入手：なし |
| アポロン・フレイム | 弱点：アクアウェーブ | 入手：なし |
【ラスト】
| ラ・ムー | 弱点：なし | 入手：なし |
【SP】
| ブライ (プレイヤーがロックマンの場合) |
弱点：なし | 入手：なし |
| エンプティー (プレイヤーがハープ・ノートの場合) |
弱点：なし | 入手：なし |
| トライブキング・ロックマン (プレイヤーがブライの場合) |
弱点：なし | 入手：なし |
※SPボスはゲーム開始からラスボス撃破までのタイムが短いと出現。
相性(弱点攻撃による攻略例)
【第一部】
ファントム→イエティ→コンドル→ブラキオ→ゴート→(ファントム...)
【第一部】
ファントム→イエティ→コンドル→ブラキオ→ゴート→(ファントム...)
SSR3コース
【第一部】
| スペード・マグネッツ | 弱点：コガラシ | 入手：エレキスラッシュ |
| ダイヤ・アイスバーン | 弱点：エレキスラッシュ | 入手：アイススピニング |
| クラブ・ストロング | 弱点：ゴールドメテオ | 入手：コガラシ |
| ムーン・ディザスター | 弱点：アイススピニング | 入手：ゴールドメテオ |
【第二部】
| ジャック・コーヴァス | 弱点：ネバーレイン | 入手：デスサイズ |
| クイーン・ヴァルゴ | 弱点：エレキスラッシュ | 入手：ネバーレイン |
【第三部】
| アシッド・エース | 弱点：なし | 入手：なし |
| グレイブ・ジョーカー | 弱点：なし | 入手：なし |
【ラスト】
| クリムゾンドラゴン | 弱点：なし | 入手：なし |
【SP】
| シリウス | 弱点：なし | 入手：なし |
※SPボスはゲーム開始からラスボス撃破までのタイムが短いと出現。
相性(弱点攻撃による攻略例)
【第一部】
スペード→ダイヤ→ムーン→クラブ→(スペード...)
【第二部】
クイーン→ジャック
【第一部】
スペード→ダイヤ→ムーン→クラブ→(スペード...)
【第二部】
クイーン→ジャック
フリーモードのみ
| ペガサス・マジック | 弱点：ライメイザン | 入手：なし |
| レオ・キングダム | 弱点：チェインバブル | 入手：なし |
| ドラゴン・スカイ | 弱点：テイルバーナー | 入手：なし |
| パーフェクト・ジェミニ | 弱点：なし | 入手：なし |
| アシッド・イリーガル | 弱点：なし | 入手：なし |
| クロックマン | 弱点：なし | 入手：なし |
| フォルテ | 弱点：なし | 入手：なし |
